Không lâu sau khi phát hành, Bóng tối Jazz đã xuất hiện trong danh sách "Top 5 album đáng nghe nhất năm 2016" của báo Tuổi trẻ với lời ngợi khen vừa phát huy được tài năng của các ca sĩ, vừa thể hiện chất "nữ tính" của nhạc sĩ.[64][65] Ngoài ra, album còn lọt vào "top 8 những đĩa nhạc Việt của năm 2015"[66][67] và "top 5 đĩa nhạc gây tiếng vang trong làng nhạc Việt năm 2015" của báo Công luận.[68]

Hầu hết các nhận xét dành cho album đều rất tích cực, đề cao hòa âm tinh tế, "không gian ca từ nhiều chiều sâu cùng lối hát đi từ nhẹ nhàng ngọt ngào tới bùng nổ cảm xúc".[36] Các nhận xét đều đồng tình cho rằng Giáng Son đã "thỏa sức vùng vẫy trong những ngóc ngách tâm hồn mình", từ đó giúp cô "tiến thêm một bước dài trên hành trình âm nhạc".[69][70]

Mặt khác, giới chuyên môn cũng đề cao tài năng của Trần Thu Hà và Tùng Dương[11][71][72] khi vừa có lối hát cổ điển lại vừa có những ngẫu hứng, "...thể hiện độ chín muồi về nghề và đời, đưa người nghe trở về một thời tuổi trẻ với trái tim yêu nồng nhiệt"[51] và "làm giàu thêm rất nhiều cho hòa âm vốn đã rất đẹp", đúng với sở trường và hợp với tính cách của họ[35]. Bóng tối Jazz cũng nổi bật với những hòa âm khác biệt của Thanh Tâm cho Tùng Dương, và của Vũ Quang Trung cho Trần Thu Hà. Chính những khác biệt về màu sắc "Mỹ" và "Việt Nam" đã "tạo nên cho người nghe một cảm giác dễ chịu."[35][73] Chất lượng cao của sản phẩm[74] được coi là "xứng đáng với bảy năm chiu chắt của Giáng Son, với đồng tiền mà người mua sẽ bỏ ra."[11]

Một số tờ báo cho rằng với album này, Giáng Son đã cho thấy mình giống với Đỗ Bảo khi chọn tầng lớp khán giả trí thức "không còn trẻ, không còn yêu si mê cuồng dại như trước" với "cái nhìn duy mỹ, luôn có đời sống, luôn rất thật".[51] Bản thân nhạc sĩ Đỗ Bảo cho dù ấn tượng vì đây là một album nhạc jazz hiếm của Việt Nam, với sự tham gia của nhiều nghệ sĩ trong nghề với những kỹ thuật chỉnh âm điêu luyện, nhưng cũng cho rằng "ngôn ngữ lời thơ mơ hồ" cùng "nền nhạc nhiều chiêm nghiệm" khiến album "trưng trổ nhiều nhưng không hiệu quả."[7]

Một số đánh giá đề cập tới việc thể hiện của các ca sĩ đôi lúc còn vênh, giọng hát lúc thì thiếu "khao khát rạo rực"[75] lúc lại "quá cầu kỳ" khiến "người nghe bị mệt".[33] Một số ý kiến khác cho rằng Bóng tối Jazz "không đem lại sức lan tỏa mạnh mẽ như kỳ vọng... và đi theo sự thoái trào với cái "độc", "lạ" thời hậu Nhật thực (2002)."[76]

Tại lễ trao giải thưởng âm nhạc Cống hiến lần thứ 11 năm 2016, Bóng tối Jazz giành chiến thắng tại hạng mục "Album của năm" và giúp Giáng Son có được đề cử cho "Nhạc sĩ của năm".